MUMmerGPU on Tesla GPUs
MUMmerGPU為生物資訊軟體，使用GPU進行高流量序列比對。此軟體利用NVIDIA Tesla GPU的龐大平行CUDA架構，能加速進行多個查詢序列和單一參考序列的比對。
下載與安裝
- 下載MUMmerGPU
- 安裝指示包含於軟體下載中
測試數據
相較於運作於CPU上的MUMmer，MUMmerGPU (版本2.0)的速度快上3至4倍。下列圖表的數據為基於MUMmerGPU 版本1.0，即將進行更新。
 數據由美國馬里蘭大學提供 |
技術文章與簡報
- 使用繪圖處理器的高流量序列校正, M. Schatz et al.: BMC Bioinformatics 2007
- 最佳化DNA序列比對的高密度GPGPU運算, C. Trapnell, M. Schatz: Parallel Computing Aug 2009
- 更多有關利用GPU加速生物資訊應用程式的出版品。
論壇
GPU 解決方案
使用者可在搭載繪圖處理器的桌上型個人超級電腦或資料中心中，進行Tesla Bio Workbench應用程式配置。 這些建構於革命性大量平行CUDA架構上的解決方案是針對加速運算科學的研究結果而量身設計而成。
建議硬體配置
| 桌上型工作站配置 | 資料中心配置 |
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