LAMMPS on Tesla GPUs
LAMMPS是一款經典的分子動力學套件,專門針對能夠在平行系統上順暢地執行而量身設計。CUDA版本的LAMMPS是透過將力計算(force calculations)移轉到繪圖處理器上來進行加速。
下載與安裝
- GPU LAMMPS
- GPU LAMMPS碼可支援MPI,並可發展為一個大型的GPU叢集。
測試數據
您可以從以下測試結果看出,利用繪圖處理器執行LAMMPS將呈現出顯著的效能提升。利用兩顆Tesla繪圖處理器執行 GPU-LAMMPS的效能表現甚至比用24個CPU來執行程式的結果還要優異。
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| 以上數據由Oak Ridge國家實驗室Scott Hampton 與 Pratul K. Agarwal提供 |
技術文章與簡報
- 2009年超級電腦大會(SC09): 駕馭GPU的優異速度,為LAMMPS粒子模擬工作進行加速 - 桑迪亞國家實驗室(Sandia National Laboratory)Paul Crozier
- 利用GPU為分子動力學應用程式進行加速
- 利用GPU為量子化學應用程式進行加速
訪談 /影片
- 2009年超級電腦大會(SC09): Sandia國家實驗室Paul Crozier談論利用繪圖處理器提供比中央處理器快上100倍的LAMMPS加速
論壇
GPU 解決方案
使用者可在搭載繪圖處理器的桌上型個人超級電腦或資料中心中,進行Tesla Bio Workbench應用程式配置。 這些建構於革命性大量平行CUDA架構上的解決方案是針對加速運算科學的研究結果而量身設計而成。
建議硬體配置
| 桌上型工作站配置 | 資料中心配置 |
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