GPU-HMMER on Tesla GPUs
GPU-HMMER為生物資訊軟體，利用NVIDIA Tesla GPU的龐大平行CUDA架構，此軟體使用隱藏馬可夫模型(HMM)執行蛋白質序列比對。GPU-HMMER的速度較HMMER(2.0)快上60至100倍
下載與安裝
測試數據
GPU-HMMER利用GPU加速隱藏馬可夫模型搜尋(hmmsearch)工具，速度可提升60至100倍。GPU-HMMER能利用單一工作站上的多個Tesla GPU，將搜尋時間由CPU所需的數小時大幅縮減為使用GPU僅需的幾分鐘。
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技術文章與簡報
- 用於肝臟影像分割和HMMER資料庫搜尋的GPU評估, J. P. Walters, V. Balu, S. Kompalli, and V. Chaudhary: 國際平行和分散式處理研討會 (IPDPS), 2009
- 更多有關利用GPU加速生物資訊應用程式的出版品。
論壇
GPU 解決方案
使用者可在搭載繪圖處理器的桌上型個人超級電腦或資料中心中，進行Tesla Bio Workbench應用程式配置。 這些建構於革命性大量平行CUDA架構上的解決方案是針對加速運算科學的研究結果而量身設計而成。
建議硬體配置
| 桌上型工作站配置 | 資料中心配置 |
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