CUDA-BLASTP on Tesla GPUs
CUDA-BLASTP利用NVIDIA Tesla GPU的龐大平行CUDA架構，藉以加速掃描蛋白質序列資料庫的NCBI BLAST的速度。CUDA-BLASTP還具有能將FASTA格式資料庫轉換為CUDA BLASTP可讀檔案的功能。
下載與安裝
- 下載CUDA-BLASTP
- CUDA-BLASTP讀我檔案(安裝, 使用指南)
測試數據
相較於在只有一顆Intel i7-920 CPU的工作站上運作的NCI BLAST (2.2.22)，在具有兩顆Tesla C1060 GPU的工作站上運作的CUDA-BLASTP，其速度可較前者快上十倍。藉由此提升，利用CPU需費上好幾分鐘的運算時間被大幅縮減為使用GPU只需幾秒鐘。
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| 以上數據由聖地牙哥超級運算中心提供 |
技術文章與簡報
- 新加坡南洋理工大學即將發佈一份有關CUDA-BLASTP的技術報告。
- 更多有關利用GPU加速生物資訊應用程式的出版品。
論壇
GPU 解決方案
使用者可在搭載繪圖處理器的桌上型個人超級電腦或資料中心中，進行Tesla Bio Workbench應用程式配置。 這些建構於革命性大量平行CUDA架構上的解決方案是針對加速運算科學的研究結果而量身設計而成。
建議硬體配置
| 桌上型工作站配置 | 資料中心配置 |
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